南京审计大学继续教育学院负责南京审计大学成人高等教育、高等教育自学考试等。学院内设有党政办公室、成人教育部、自学考试部三个管理部门。

南京审计大学成人高等教育创办于1992年，继续教育学院依据学校审计特色办学定位，结合学校已有的全日制专业基础，根据地方经济发展需要，进行我校成人教育专业设置与调整，构建了较为合理的学科专业结构体系。目前，学院开设成人教育专业19个，在全国设有19个校外教学点，成人教育在校生1.5万余人。

南京审计大学是江苏省高等教育自学考试主考学校之一。学院负责南京审计大学各类自学考试组织与管理工作。 审计学是我校的特色品牌专业，设置为社会自考和专科接读本科的专业；自学考试助学专业，在普本在校生中开办的本科第二学历教育是学院近年来大力发展的办学形式，开设有会计学、金融学、英语、法学四个专业。目前已有二十多所专科院校与我校对接开办“专接本”教育，本科二学历教育已连年招生，各类自学考试在籍（考籍）学生2500多名。